XOOPSを社内の部門サイトに使わせてもらっています。 上記の手順でひとしきりアップロードし終わったのですが、 ３．１で FETAL: open error: site setting config. と表示されて前に進みません。 チェックツールも同じ表示になります。 気になる点は、 ・サイトがWindowsサーバであること ・このサーバが社内のAD配下にあること です。 パーミッションを変更するとして、どうしていいのかちょっと分からず、とりあえず自分のIDで書き込めることと、admin系の他のIDにも同じ更新権限がつけられていることは確認しました（少なくとも参照のみはなし）。 それ以外で確認することがありますか？

mainfile.phpにちゃんとXOOPS_ROOT_PATHの設定がされていないのかもしれませんね。
ご確認くださいませ。